慢性肾小球肾炎是一种有不断进展倾向的肾小球疾病，至今还没有特效疗法，但由于近年来对其发病机理的研究不断进展，治疗措施也有很大的改进，规范的中西医结合治疗，其预后已大为改观。慢性肾小球肾炎预后的好坏与很多因素有关。其中引起慢性肾小球肾炎的病因是否容易在治疗干预下被去除掉，目前的临床表现是否严重，病情是相对稳定还是有明显的进展或恶化的趋势，肾脏的病理类型是否难治，以及肾脏功能受损程度是否严重等因素都与慢性肾小球肾炎的预后的好坏有关系。如果慢性肾小球肾炎反复急性发作，肾功能恶化的速度比较明显，会加速进入肾功能衰竭期的时间；如经过规范的治疗，病情控制比较稳定，有的患者可历经很长时间才发展成肾功能衰竭，有的还可以带病延年。山东中医药大学附属医院肾内科郭兆安介绍说，影响慢性肾小球肾炎的预后的因       素有如下几个方面：
        首先，病理类型是影响慢性肾小球肾炎患者的预后的很重要的因素。如微小病变或轻度局灶性肾炎经合理的治疗后可以痊愈；而膜增生性肾小球肾炎则预后相对较差；若肾小球有新月体形成或肾小球硬化的患者则提示病变较重，预后较差。具体的病理类型需要行肾脏活检的病理检查。
其次，慢性肾小球肾炎的临床表现与预后密切相关。对于那些单纯蛋白尿或镜下血尿，而无其它伴随症状的慢性肾小球肾炎患者，一般预后较好；慢性肾炎出现持续性高血压者比无高血压的患者预后差。有的患者血压虽高，但是经一般降压药物治疗能使血压降到正常或稍高于正常水平者，预后较好，反之预后较差。有持续性贫血不能改善的慢性肾小球肾炎患者预后较差。
         然后值得注意的是，引起肾实质病变的前驱或基础疾病的类型与慢性肾小球肾炎患者的预后密切相关：如扁桃体炎、上呼吸道感染等溶血性链球菌引起的慢性肾小球肾炎预后较好；继发于全身性疾病而且病因不易去除的慢性肾小球肾炎患者，预后较差。
        慢性肾小球肾炎患者的肾功能情况也是影响预后的关键因素之一。如果患者的肾功能受损严重，实验室检查可见血肌酐、尿素氮升高，内生肌酐清除率下降者，预后严重；如果患者的肾功能正常或肾功能虽然受损，经积极治疗能恢复正常者，预后相对较好；若患者已发展到慢性肾功能衰竭或尿毒症期，则预后较差。
此外，慢性肾小球肾炎患者的预后还和患者的精神状态、饮食控制、是否早期积极治疗、是否接受了正规的治疗等多种因素有关。